MikroTik ierīcēs var strādāt gan ar WPA (Wi-Fi Protected Access), gan ar WPA2 (Wi-Fi Protected Access II), kas ir bezvadu tīklu drošības protokoli.

Faktiski MikroTik atbalsta virkni bezvadu drošības konfigurāciju, tostarp:

• WPA-PSK: autentifikācijai izmanto iepriekš koplietotu atslēgu.
• WPA2-PSK: drošāka WPA versija, kas izmanto arī iepriekš koplietotu atslēgu, bet ar uzlabotu šifrēšanas algoritmu (AES, nevis TKIP, ko izmanto WPA).
• WPA-Enterprise un WPA2-Enterprise: Tie izmanto RADIUS serveri, lai autentificētu lietotājus, piedāvājot vēl augstāku drošības līmeni, kas piemērots uzņēmuma vidēm.

Tā drošības uzlabojumu dēļ priekšroka tiek dota WPA2, nevis WPA, un tas ir ieteicamais drošības standarts personiskai un biznesa lietošanai.

MikroTik ir arī izveidojis WPA3 atbalstu dažās savās jaunākajās ierīcēs, kas piedāvā vēl spēcīgāku aizsardzību nekā WPA2.